Consequences of a telomerase-related fitness defect and chromosome substitution technology in yeast synIX strains - Institut Curie Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Cell Genomics Année : 2023

Consequences of a telomerase-related fitness defect and chromosome substitution technology in yeast synIX strains

Laura Mcculloch
Vijayan Sambasivam
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Amanda Hughes
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Narayana Annaluru
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Sivaprakash Ramalingam
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Viola Fanfani
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Evgenii Lobzaev
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Leslie Mitchell
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Jitong Cai
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Hua Jiang
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John Lacava
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Martin Taylor
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William Bishai
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Giovanni Stracquadanio
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Lars Steinmetz
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Joel Bader
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Weimin Zhang
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Jef Boeke
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Srinivasan Chandrasegaran
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Breeana Anderson
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Abena Apaw
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Pavlo Bohutskyi
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Erin Buchanan
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Daniel Chang
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Melinda Chen
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Eric Cooper
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Amanda Deliere
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Kallie Drakos
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Justin Dubin
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Christopher Fernandez
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Zheyuan Guo
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Thomas Harrelson
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Dongwon Lee
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Jessica Mcdade
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Scott Melamed
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Héloise Müller
Adithya Murali
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José Niño Rivera
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Mira Patel
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Mary Rodley
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Jenna Schwarz
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Nirav Shelat
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Josh Sims
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Barrett Steinberg
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James Steinhardt
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Rishi Trivedi
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Christopher von Dollen
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Tianyi Wang
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Remus Wong
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Yijie Xu
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Noah Young
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Karen Zeller
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Allen Zhang
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Résumé

We describe the complete synthesis, assembly, debugging, and characterization of a synthetic 404,963 bp chromosome, synIX (synthetic chromosome IX). Combined chromosome construction methods were used to synthesize and integrate its left arm (synIXL) into a strain containing previously described synIXR. We identified and resolved a bug affecting expression of EST3, a crucial gene for telomerase function, producing a synIX strain with near wild-type fitness. To facilitate future synthetic chromosome consolidation and increase flexibility of chromosome transfer between distinct strains, we combined chromoduction, a method to transfer a whole chromosome between two strains, with conditional centromere destabilization to substitute a chromosome of interest for its native counterpart. Both steps of this chromosome substitution method were efficient. We observed that wild-type II tended to co-transfer with synIX and was co-destabilized with wild-type IX, suggesting a potential gene dosage compensation relationship between these chromosomes.
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Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-04658941 , version 1 (23-07-2024)

Identifiants

Citer

Laura Mcculloch, Vijayan Sambasivam, Amanda Hughes, Narayana Annaluru, Sivaprakash Ramalingam, et al.. Consequences of a telomerase-related fitness defect and chromosome substitution technology in yeast synIX strains. Cell Genomics, 2023, 3 (11), pp.100419. ⟨10.1016/j.xgen.2023.100419⟩. ⟨hal-04658941⟩
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